真核生物は、原核細胞ではない生物を指す(約20億年前に原核生物から進化したとされている)。1つの細胞の中でそれぞれが役割をもつ小胞が存在しており、1つの細胞が果たすべき役割をそれぞれの細胞内小胞が分業している。
下図は動物の細胞
細胞内が区画化されているのでそれぞれが異なるpHを持つこともできる。例えば、核内はpH=7.4だがリソソーム内はpH=4.5である。
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